MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Zymomonas mobilis subsp. mobilis ATCC 10988 plasmid pZMOB04

Total Repeats: 416

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017184	CA	3	6	36	41	50 %	0 %	0 %	50 %	384410913
2	NC_017184	ATCTG	2	10	146	155	20 %	40 %	20 %	20 %	384410913
3	NC_017184	A	6	6	240	245	100 %	0 %	0 %	0 %	384410913
4	NC_017184	TGAG	2	8	255	262	25 %	25 %	50 %	0 %	384410913
5	NC_017184	TTG	2	6	273	278	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384410914
6	NC_017184	ATT	2	6	346	351	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384410914
7	NC_017184	TAT	2	6	383	388	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384410914
8	NC_017184	CTG	2	6	408	413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384410914
9	NC_017184	ACC	2	6	438	443	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384410914
10	NC_017184	CATT	2	8	444	451	25 %	50 %	0 %	25 %	384410914
11	NC_017184	AAC	2	6	569	574	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384410914
12	NC_017184	TAC	2	6	685	690	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_017184	TGA	2	6	697	702	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017184	GTAT	2	8	717	724	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017184	GTG	2	6	806	811	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017184	AAT	2	6	855	860	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017184	ATT	2	6	883	888	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384410915
18	NC_017184	AAT	2	6	891	896	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384410915
19	NC_017184	T	6	6	898	903	0 %	100 %	0 %	0 %	384410915
20	NC_017184	T	6	6	941	946	0 %	100 %	0 %	0 %	384410915
21	NC_017184	CTCAT	2	10	1047	1056	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
22	NC_017184	CT	3	6	1162	1167	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
23	NC_017184	GAT	2	6	1211	1216	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017184	A	6	6	1261	1266	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017184	AAG	2	6	1274	1279	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017184	AAT	2	6	1384	1389	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017184	ATC	2	6	1427	1432	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384410916
28	NC_017184	GCT	2	6	1473	1478	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384410916
29	NC_017184	ATG	2	6	1483	1488	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384410916
30	NC_017184	GCT	2	6	1497	1502	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384410916
31	NC_017184	TAT	2	6	1533	1538	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384410916
32	NC_017184	GAC	2	6	1545	1550	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384410916
33	NC_017184	AC	3	6	1549	1554	50 %	0 %	0 %	50 %	384410916
34	NC_017184	TGA	2	6	1622	1627	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384410916
35	NC_017184	AGA	2	6	1746	1751	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384410917
36	NC_017184	TGC	2	6	1759	1764	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384410917
37	NC_017184	TG	3	6	1786	1791	0 %	50 %	50 %	0 %	384410917
38	NC_017184	CGC	2	6	1820	1825	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384410917
39	NC_017184	GGC	2	6	1892	1897	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384410917
40	NC_017184	TTC	3	9	1910	1918	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384410917
41	NC_017184	GA	3	6	1951	1956	50 %	0 %	50 %	0 %	384410917
42	NC_017184	TTA	2	6	1967	1972	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384410917
43	NC_017184	TTC	2	6	2008	2013	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384410917
44	NC_017184	CAG	2	6	2026	2031	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384410917
45	NC_017184	CTGAC	2	10	2054	2063	20 %	20 %	20 %	40 %	384410917
46	NC_017184	GGC	2	6	2088	2093	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384410917
47	NC_017184	ATC	2	6	2221	2226	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384410917
48	NC_017184	GCCT	2	8	2241	2248	0 %	25 %	25 %	50 %	384410917
49	NC_017184	CGA	2	6	2261	2266	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384410917
50	NC_017184	GGC	2	6	2288	2293	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384410917
51	NC_017184	ACG	2	6	2400	2405	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384410917
52	NC_017184	A	6	6	2439	2444	100 %	0 %	0 %	0 %	384410917
53	NC_017184	TCAC	2	8	2488	2495	25 %	25 %	0 %	50 %	384410917
54	NC_017184	CTCAA	2	10	2538	2547	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
55	NC_017184	GGT	2	6	2634	2639	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017184	CTT	2	6	2760	2765	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_017184	A	6	6	2865	2870	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017184	TAGAA	2	10	2917	2926	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017184	AGC	2	6	2929	2934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_017184	T	7	7	2989	2995	0 %	100 %	0 %	0 %	384410918
61	NC_017184	TA	3	6	3003	3008	50 %	50 %	0 %	0 %	384410918
62	NC_017184	TCA	2	6	3059	3064	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384410918
63	NC_017184	TTA	2	6	3149	3154	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384410918
64	NC_017184	A	6	6	3185	3190	100 %	0 %	0 %	0 %	384410918
65	NC_017184	GCTGCA	2	12	3191	3202	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384410918
66	NC_017184	GATT	2	8	3212	3219	25 %	50 %	25 %	0 %	384410918
67	NC_017184	ATT	2	6	3263	3268	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017184	ATTC	2	8	3274	3281	25 %	50 %	0 %	25 %	384410919
69	NC_017184	AT	3	6	3305	3310	50 %	50 %	0 %	0 %	384410919
70	NC_017184	CAA	2	6	3350	3355	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384410919
71	NC_017184	CGA	3	9	3394	3402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384410919
72	NC_017184	TCA	2	6	3497	3502	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384410919
73	NC_017184	TCA	2	6	3541	3546	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384410919
74	NC_017184	ATC	2	6	3561	3566	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384410919
75	NC_017184	CAT	2	6	3578	3583	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384410919
76	NC_017184	GAG	2	6	3590	3595	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384410919
77	NC_017184	AAG	2	6	3606	3611	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384410919
78	NC_017184	ATA	2	6	3670	3675	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384410919
79	NC_017184	AGC	2	6	3789	3794	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384410919
80	NC_017184	AAT	2	6	3918	3923	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384410919
81	NC_017184	CAT	2	6	4001	4006	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_017184	ATA	2	6	4031	4036	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017184	A	6	6	4061	4066	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017184	TGACAT	2	12	4072	4083	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_017184	CAA	3	9	4134	4142	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384410920
86	NC_017184	A	6	6	4154	4159	100 %	0 %	0 %	0 %	384410920
87	NC_017184	GAA	2	6	4190	4195	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384410920
88	NC_017184	AGA	2	6	4276	4281	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384410920
89	NC_017184	CCA	2	6	4355	4360	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384410920
90	NC_017184	A	6	6	4380	4385	100 %	0 %	0 %	0 %	384410920
91	NC_017184	ATT	2	6	4437	4442	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384410921
92	NC_017184	A	6	6	4518	4523	100 %	0 %	0 %	0 %	384410921
93	NC_017184	TAT	2	6	4582	4587	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384410921
94	NC_017184	TGT	2	6	4662	4667	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384410921
95	NC_017184	GGC	2	6	4676	4681	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384410921
96	NC_017184	ATA	2	6	4750	4755	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384410921
97	NC_017184	TGA	2	6	4806	4811	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384410921
98	NC_017184	ATG	2	6	4864	4869	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384410921
99	NC_017184	TGA	2	6	4871	4876	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384410921
100	NC_017184	TTGAG	2	10	4932	4941	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017184	TGT	2	6	4947	4952	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384410922
102	NC_017184	T	6	6	5035	5040	0 %	100 %	0 %	0 %	384410922
103	NC_017184	CGT	2	6	5074	5079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384410922
104	NC_017184	GCC	2	6	5186	5191	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384410922
105	NC_017184	TCG	2	6	5213	5218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384410922
106	NC_017184	GCAG	2	8	5229	5236	25 %	0 %	50 %	25 %	384410922
107	NC_017184	TGA	2	6	5252	5257	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384410922
108	NC_017184	GCC	2	6	5386	5391	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384410922
109	NC_017184	CAGGT	2	10	5413	5422	20 %	20 %	40 %	20 %	384410922
110	NC_017184	CTG	2	6	5448	5453	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384410922
111	NC_017184	GAA	2	6	5466	5471	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384410922
112	NC_017184	TAA	2	6	5507	5512	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384410922
113	NC_017184	TC	3	6	5523	5528	0 %	50 %	0 %	50 %	384410922
114	NC_017184	CCG	2	6	5556	5561	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384410922
115	NC_017184	AAG	2	6	5562	5567	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384410922
116	NC_017184	GCC	2	6	5582	5587	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384410922
117	NC_017184	GGC	2	6	5653	5658	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384410922
118	NC_017184	CA	3	6	5688	5693	50 %	0 %	0 %	50 %	384410922
119	NC_017184	GCA	2	6	5715	5720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384410922
120	NC_017184	TCT	2	6	5728	5733	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384410922
121	NC_017184	TTTCC	2	10	5899	5908	0 %	60 %	0 %	40 %	384410923
122	NC_017184	GA	3	6	5935	5940	50 %	0 %	50 %	0 %	384410923
123	NC_017184	GAGATA	2	12	5968	5979	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	384410923
124	NC_017184	ACG	3	9	5984	5992	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384410923
125	NC_017184	CCT	2	6	6057	6062	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
126	NC_017184	AGG	2	6	6065	6070	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017184	AAT	2	6	6100	6105	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017184	TGC	2	6	6115	6120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_017184	TGT	2	6	6147	6152	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017184	TTAA	2	8	6172	6179	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017184	TTAA	2	8	6225	6232	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017184	GTATTT	2	12	6244	6255	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	384410924
133	NC_017184	T	7	7	6264	6270	0 %	100 %	0 %	0 %	384410924
134	NC_017184	ATT	2	6	6294	6299	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384410924
135	NC_017184	ACCG	2	8	6306	6313	25 %	0 %	25 %	50 %	384410924
136	NC_017184	AAT	3	9	6315	6323	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384410924
137	NC_017184	T	6	6	6472	6477	0 %	100 %	0 %	0 %	384410924
138	NC_017184	T	6	6	6492	6497	0 %	100 %	0 %	0 %	384410924
139	NC_017184	TAA	2	6	6523	6528	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384410924
140	NC_017184	TGT	2	6	6540	6545	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384410924
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142	NC_017184	ATA	2	6	6618	6623	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384410925
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146	NC_017184	GTTT	2	8	6666	6673	0 %	75 %	25 %	0 %	384410925
147	NC_017184	AT	3	6	6683	6688	50 %	50 %	0 %	0 %	384410925
148	NC_017184	GTT	2	6	6719	6724	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384410925
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152	NC_017184	TAAA	2	8	6849	6856	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_017184	ATT	2	6	6857	6862	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_017184	T	6	6	6871	6876	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
155	NC_017184	T	7	7	6892	6898	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
156	NC_017184	T	6	6	6906	6911	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
157	NC_017184	TAAAT	2	10	6913	6922	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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161	NC_017184	GAC	2	6	7063	7068	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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165	NC_017184	TAC	2	6	7144	7149	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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252	NC_017184	A	7	7	11532	11538	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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255	NC_017184	AACA	2	8	11586	11593	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
256	NC_017184	TA	3	6	11612	11617	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
257	NC_017184	AAT	2	6	11666	11671	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
258	NC_017184	T	6	6	11709	11714	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
259	NC_017184	GCCA	2	8	11734	11741	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
260	NC_017184	T	6	6	11767	11772	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
261	NC_017184	TC	3	6	11805	11810	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
262	NC_017184	AGC	2	6	11827	11832	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
263	NC_017184	CTCAT	2	10	11858	11867	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
264	NC_017184	GCT	2	6	11924	11929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
265	NC_017184	TCAA	2	8	11930	11937	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
266	NC_017184	TTC	2	6	11958	11963	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
267	NC_017184	TA	4	8	12005	12012	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
268	NC_017184	GTCA	2	8	12015	12022	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
269	NC_017184	A	6	6	12053	12058	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
270	NC_017184	A	6	6	12235	12240	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
271	NC_017184	TCG	2	6	12261	12266	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
272	NC_017184	T	6	6	12338	12343	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
273	NC_017184	AAT	2	6	12359	12364	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
274	NC_017184	TGGA	2	8	12379	12386	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
275	NC_017184	TAC	2	6	12403	12408	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
276	NC_017184	TAT	2	6	12414	12419	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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278	NC_017184	TA	3	6	12440	12445	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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413	NC_017184	TTA	2	6	18335	18340	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
414	NC_017184	AG	3	6	18411	18416	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
415	NC_017184	ATT	2	6	18441	18446	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
416	NC_017184	ATAA	2	8	18454	18461	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.